Charlie PAUVERT - Admis au titre de docteur

Identifiant ORCID 0000-0001-9832-2507

Expérience professionnelle :
En recherche d'emploi depuis le 18 novembre 2019

Doctorat Écologie évolutive, fonctionnelle et des communautés

Thèse soutenue le 12 novembre 2019 - Université de Bordeaux

Ecole doctorale : Sciences et environnements

Sujet : Comparaison et évaluation d’approches bioinformatiques et statistiques pour l'analyse du pathobiome des plantes cultivées.

Mots-clés de la thèse : Ecologie microbienne,Réseaux écologiques,Métabarcoding,Inférence de réseaux,Biocontrôle,Pathobiome,

Direction de thèse : Corinne VACHER

Co-direction de thèse : Jessica VALLANCE

Unité de recherche : BIOGECO - BIOdiversité, Gènes & Communautés UMR 1202 - CESTAS

Master - BioInformatique Modelisation et Statistique

obtenu en juin 2016 - Université de Rouen
Option : Bioinformatique

Production scientifique

- Charlie Pauvert, Marc Buée, Valérie Laval, Véronique Edel-Hermann, Laure Fauchery, Angélique Gautier, Isabelle Lesur, Jessica Vallance, Corinne Vacher 2019. Bioinformatics matters: The accuracy of plant and soil fungal community data is highly dependent on the metabarcoding pipeline Fungal Ecology, 41, p. 23-33, https://doi.org/10.1016/j.funeco.2019.03.005
- Charlie Pauvert, Jessica Vallance, Laurent Delière, David Bohan, Marc Buée, Corinne Vacher 2019. Inferred microbial networks lack replicability: consequences for next-generation biomonitoring. Molecular Ecology Resources, ns,
- Stéphane Derocles, David Bohan, Alex J Dumbrell, James J. N. Kitson, Francois Massol, Charlie Pauvert, Manuel Plantagenest, Corinne Vacher, Darren Evans 2018. Biomonitoring for the 21st Century: Integrating Next-Generation Sequencing Into Ecological Network Analysis Advances in Ecological Research, 58, pp.1-62,

Dernière mise à jour le 20 novembre 2019