Objectifs :
L'objectif de ce mini-cours est de sensibiliser le public au problèmes de tests multiples qui interviennent fréquemment lorsque l'on prend une décision à partir d'un grand nombre de tests statistiques, par exemple lorsque l'on teste la différence d'expression génétiques sur des milliers de gènes. L'objectif du cours est d'illustrer ce problème qui a mener à de nombreux travaux de recherche qui n'ont pas pu être reproduits, et de faire prendre conscience d'une nécessité de définir des mesures de risques associés à ce problème. Le cours développera ensuite des procédures standard et très populaires qui permettent de contrôler le FWER (familywiser-error-rate) ou le FDR (false discovery rate). L'objectif du cours est de comprendre comment sont construites ces procédures, comment elles s'implémentent et surtout quelles sont leurs limites. L'auditeur/auditrice devrait ensuite être à même de pouvoir lire de plus récents travaux du domaine, être critique face à l'utilisation de tests en grande dimension dans un esprit de recherche reproductible

Programme :
L'objectif de ce mini-cours est de sensibiliser le public au problèmes de tests multiples qui interviennent fréquemment lorsque l'on prend une décision à partir d'un grand nombre de tests statistiques, par exemple lorsque l'on teste la différence d'expression génétiques sur des milliers de gènes. L'objectif du cours est d'illustrer ce problème qui a mener à de nombreux travaux de recherche qui n'ont pas pu être reproduits, et de faire prendre conscience d'une nécessité de définir des mesures de risques associés à ce problème. Le cours développera ensuite des procédures standard et très populaires qui permettent de contrôler le FWER (familywiser-error-rate) ou le FDR (false discovery rate). L'objectif du cours est de comprendre comment sont construites ces procédures, comment elles s'implémentent et surtout quelles sont leurs limites. L'auditeur/auditrice devrait ensuite être à même de pouvoir lire de plus récents travaux du domaine, être critique face à l'utilisation de tests en grande dimension dans un esprit de recherche reproductible

Pré-requis :
Avoir des notions de statistique (et probabilités) et avoir déjà manipulé/utilisé/construit des tests statistiques paramétriques.

Equipe pédagogique :
Jean-François Coeurjolly

Méthode pédagogique :
2 séances, 9h-12h, les 11 et 13 fevrier.

Les Compétences et capacités visées à l'issue de la formation (fiches RNCP)

Arrêté du 22 février 2019 définissant les compétences des diplômés du doctorat et inscrivant le doctorat au répertoire national de la certification professionnelle. https://www.legifrance.gouv.fr/loda/id/JORFTEXT000038200990/

Bloc 1 : Concevoir et élaborer une démarche de recherche, de R&D ou d'innovation

- Disposer d'une expertise scientifique tant générale que spécifique d'un domaine de recherche et de travail déterminé

- Faire le point sur l'état et les limites des savoirs et des pratiques au sein d'un secteur d'activité déterminé, aux échelles locale, nationale ou internationale

Bloc 4 : Assurer une veille scientifique et technologique de haut niveau à l’échelle internationale

- Acquérir, synthétiser et analyser les données et les informations scientifiques et technologiques d’avant- garde à l’échelle internationale en développant un regard critique et distancié

- Dépasser les frontières des données et du savoir disponibles par croisement avec différents champs de la connaissance ou d'autres secteurs professionnels

La formation participe à l'objectif suivant :être directement utile pour la réalisation des travaux personnels de recherche