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ED CSV - Phylogénie moléculaire - Reportée début 2026 [Participation : Présentiel]

Contact : CSV ED
ed-csv@univ-grenoble-alpes.fr

Catégorie : Formations disciplinaires

Thématique : Formation à la recherche 

Langue de l'intervention : français

Nombre d'heures : 12

Nbre d'inscrits : 5

Public prioritaire : Aucun

Public concerné :
Tout doctorant de CSV- Chimie et Sciences du Vivant

Proposé par : CSV- Chimie et Sciences du Vivant


Lieu : RdC de l'IMAG -nouveau bat en face de EVE
Début de la formation : 11 septembre 2025
Fin de la formation : 16 septembre 2025
Date ouverture des inscriptions :
Date fermeture des inscriptions : 7 septembre 2025
Objectifs :

Programme :
1ère demi-journée - 11/09 - 09:00 à 12:00
- Introduction à la phylogénie
- Définitions et propriétés des arbres phylogénétiques
- TD: le format Newick
- TP: visualisation d'arbres

2ème demi-journée - 12/09 - 09:00 à 12:00
- Les modèles d'évolution
- TP: choix de modèles (LRT, AIC)
- Inférence d'arbres par les méthodes de distance (cours, TD, TP)

3ème demi-journée - 16/09 - 09:00 à 12:00
- Inférence d'arbres par les méthodes de parcimonie
- Inférence d'arbres par maximum de vraisemblance
- TP: maximum de vraisemblance

4ème demi-journée - 16/09 - 13:30 à 16:30
- Les supports de branches (cours, TD)
- Inférence d'arbres par les méthodes bayésiennes
- TP: méthode bayésienne



La formation participe à l'objectif suivant :être directement utile pour la réalisation des travaux personnels de recherche

Calendrier :

Séance n° 1
Date : 11-09-2025
Horaire : 09h00 à 12h00
Intervenant : Vincent LEFORT
Lieu : RDC IMAG
Intitulé cours : - Introduction à la phylogénie - Définitions et propriétés des arbres phylogénétiques - TD: le format Newick - TP: visualisation d'arbres
Séance n° 2
Date : 12-09-2025
Horaire : 09h00 à 12h00
Intervenant : Vincent LEFORT
Lieu : RDC IMAG
Intitulé cours : - Les modèles d'évolution - TP: choix de modèles (LRT, AIC) - Inférence d'arbres par les méthodes de distance (cours, TD, TP)
Séance n° 3
Date : 16-09-2025
Horaire : 09h00 à 12h00
Intervenant : Vincent LEFORT
Lieu : RDC IMAG
Intitulé cours : - Inférence d'arbres par les méthodes de parcimonie - Inférence d'arbres par maximum de vraisemblance - TP: maximum de vraisemblance
Séance n° 4
Date : 16-09-2025
Horaire : 13h30 à 16h30
Intervenant : Vincent LEFORT
Lieu : RDC IMAG
Intitulé cours : - Les supports de branches (cours, TD) - Inférence d'arbres par les méthodes bayésiennes - TP: méthode bayésienne

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