Objectifs :
• Acquérir des compétences de base en bioinformatique pour l'analyse du microbiome et pour la communication des résultats
• Comprendre les enjeux, outils et applications clés de la bioinformatique

Programme :
• Introduction à la bioinformatique et notions fondamentales sur les données
• Étude de cas : Analyse du microbiome par séquençage d'amplicons
• Présentation des outils et logiciels spécifiques
• Exercices pratiques : analyse, interprétation et communication des résultats bioinformatiques

Pré-requis :
• Ordinateur personnel pouvant être équipé de RStudio et ayant accès à Internet et à un logiciel de sauvegarde comme Nextcloud
• Connaissances de base et intérêt en biologie et en langage R

Equipe pédagogique :
COSME Marco ( marco.cosme@u-picardie-fr) Professeur Junior UPJV - EDYSAN

Méthode pédagogique :
Présentations théoriques et démonstrations logicielles, complétées par des exercices pratiques en temps réel pour favoriser l’appropriation des outils. L’apprentissage est évalué par la production de résultats bioinformatiques.

Compétences acquises à l'issue de la formation :
Arrêté du 22 février 2019 définissant les compétences des diplômés du doctorat et inscrivant le doctorat au RNCP

Communication ; Formations numériques ; Informatique et modélisation scientifique ; Méthodologie de la recherche ; Outils scientifiques et techniques ; Informatique et modélisation scientifique ; Méthodologie de la recherche.

Les Compétences et capacités visées à l'issue de la formation (fiches RNCP)

Arrêté du 22 février 2019 définissant les compétences des diplômés du doctorat et inscrivant le doctorat au répertoire national de la certification professionnelle. https://www.legifrance.gouv.fr/loda/id/JORFTEXT000038200990/

Bloc 1 : Conception et élaboration d’une démarche de recherche et développement, d’études et prospective

- Disposer d'une expertise scientifique tant générale que spécifique d'un domaine de recherche et de travail déterminé

- Faire le point sur l’état et les limites des savoirs au sein d’un secteur d’activité déterminé, aux échelles locale, nationale ou internationale

Bloc 4 : Veille scientifique et technologique à l’échelle internationale

- Acquérir, synthétiser et analyser les données et informations scientifiques et technologiques d’avant-garde à l’échelle internationale

- Disposer de la curiosité, de l’adaptabilité et de l’ouverture nécessaire pour se former et entretenir une culture générale de haut niveau

Bloc 5 : Formation et diffusion de la culture scientifique et technique

- Rendre compte et communiquer en plusieurs langues des travaux à caractère scientifique et technologique en direction de publics ou publications différents, à l’écrit comme à l’oral

Compétences sociales

- Adaptation ; Persévérance ; Résilience ; Gestion du changement et de l'échec ; Engagement

La formation participe à l'objectif suivant :être directement utile pour la rédaction de la thèse ou pour l’exposition écrite ou orale des travaux de recherche