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Collège Doctoral
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ED250 - MM1: Initiation aux Outils de la Modélisation Moléculaire [Participation : Présentiel]

Contact : CHUZEL Virginie
virginie.chuzel@univ-amu.fr
Tél: 04 13 94 51 63

Catégorie : Outils de la thèse - Formations scientifiques

Thématique : Formation à la recherche 

Langue de l'intervention : français

Nombre d'heures : 6

Min participants : 8

Max participants : 15

Nbre d'inscrits : 1

Nbre en attente d'inscription : 5

Nombre de places disponibles : 14

Public prioritaire : Spécialités doctorales du domaine

Public concerné :
Tout doctorant de Ecole Doctorale Sciences Chimiques

Proposé par : Ecole Doctorale Sciences Chimiques


Lieu : Campus St Jérôme Salle informatique de la Fédération de Chimie, Service A61 - Avenue Escadrille Niemen - 13013 Marseille
Observations : Cette formation est un pré-requis pour suivre la formation "Outils de la Modélisation Moléculaire appliqués à l’analyse conformationnelle et la réactivité" qui fera l'objet d'une autre annonce.
Mots clés : modélisation, chimie, méthodes quantiques
Début de la formation : 23 mars 2026
Fin de la formation : 23 mars 2026
Date ouverture des inscriptions :
Date fermeture des inscriptions : 6 mars 2026
Modalités d'inscription : Préinscription obligatoire auprès de : anouk.siri@univ-amu.fr avant Inscription sur Adum via votre espace personnel, rubrique formations.

Objectifs :
Formation à l’utilisation du cluster de calcul du CRCMM et des logiciels de chimie Agui, AMPAC et Gaussian



Programme :
Présentation du CRCMM, des outils de modélisation moléculaire et de leur champ d’applications
Bonnes pratiques d’utilisation du cluster de calculs
Présentation du logiciel de construction et de visualisation Agui
Construction de systèmes moléculaires et optimisation de géométrie
Analyse conformationnelle : problèmes et solutions
Travaux pratiques sur ordinateur

Pré-requis :
Bases de chimie organique et d’atomistique

Equipe pédagogique :
Didier Siri PR amU & Sara Chentouf IGE amU FSCM

Méthode pédagogique :
CM (présentation des concepts et des méthodes) et TP de mise en pratique sur ordinateur

Compétences acquises à l'issue de la formation :
Connaître les grandes familles de techniques de modélisation moléculaire et leur champ d’application
Construire un système moléculaire simple
Utiliser quelques commandes linux et les scripts de lancement/suivi de calculs sur le serveur du CRCMM
Trouver les géométries stables d’un système chimique simple par différentes techniques (optimisation, recuit simulé)



La formation participe à l'objectif suivant :être directement utile pour la réalisation des travaux personnels de recherche

Inscription au cours




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