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Collège Doctoral
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ED250 - MM4 : Mécanique Moléculaire, Dynamique Moléculaire et Docking [Participation : Présentiel]

Contact : CHUZEL Virginie
virginie.chuzel@univ-amu.fr
Tél: 04 13 94 51 63

Catégorie : Outils de la thèse - Formations scientifiques

Thématique : Formation à la recherche 

Langue de l'intervention : français

Nombre d'heures : 6

Min participants : 8

Max participants : 15

Nbre d'inscrits : 1

Nbre en attente d'inscription : 3

Nombre de places disponibles : 14

Public prioritaire : Spécialités doctorales du domaine

Public concerné :
Tout doctorant de Ecole Doctorale Sciences Chimiques

Proposé par : Ecole Doctorale Sciences Chimiques


Lieu : Campus St Jérôme Salle informatique de la Fédération de Chimie, Service A61 - Avenue Escadrille Niemen - 13013 Marseille
Mots clés : modélisation, chimie, méthodes quantiques
Début de la formation : 27 avril 2026
Fin de la formation : 27 avril 2026
Date ouverture des inscriptions :
Date fermeture des inscriptions : 1er avril 2026
Modalités d'inscription : Préinscription obligatoire auprès de : anouk.siri@univ-amu.fr avant Inscription sur Adum via votre espace personnel, rubrique formations.

Objectifs :
Formation à l’utilisation du cluster de calcul du CRCMM et des logiciels de chimie Gromacs, Autodock, VMD pour simuler des trajectoires de dynamique moléculaire et des interactions ligand/protéine.



Programme :
Présentation des outils dédiés au calcul et à l'analyse de trajectoires de dynamique moléculaires.
Présentation des outils dédiés au calcul et à l'analyse d'interactions ligand/protéine par docking.
Travaux pratiques sur ordinateur



Pré-requis :
Bases de chimie organique et d'atomistique

Equipe pédagogique :
Didier Siri PR amU & Sara Chentouf IGE amU FSCM

Méthode pédagogique :
CM (présentation des concepts et des méthodes) et TP de mise en pratique sur ordinateur

Compétences acquises à l'issue de la formation :
Connaître les méthodes théoriques appropriées pour simuler des trajectoires de dynamique moléculaire et des interactions ligand/protéine.




La formation participe à l'objectif suivant :être directement utile pour la réalisation des travaux personnels de recherche

Inscription au cours




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