Contact : Abélanet Sophie
abelanet@ipmc.cnrs.fr
Catégorie : Formations scientifiques (disciplinaire ou académique)
Thématique : Formation à la recherche
Langue de l'intervention : français
Nombre d'heures : 14
Min participants : 3
Max participants : 5
Nbre d'inscrits : 2
Nbre en attente d'inscription : 3
Nombre de places disponibles : 3
Public prioritaire : Aucun
Public concerné :
Doctorant(e)s
Proposé par : Sciences de la vie et de la santé
| Lieu : Centrale Méditerranée Bâtiment Premium Méridia, 61/63, avenue Simone Veil, 06200 Nice
Mots clés : Analyse d'images, shallow learning, deep learning
Début de la formation : 27 avril 2026
Fin de la formation : 28 avril 2026
Date ouverture des inscriptions :
Date fermeture des inscriptions : 23 avril 2026
Objectifs :
Acquérir, par une alternance de cours et de travaux pratiques, les principes et outils utilisant le Shallow learning et Deep Learning pour l'analyse d’images
Programme :
Classification de pixels, classification d'objets, réseaux de neurones, shallow learning, deep learning, Logiciels utilisés : Ilastik, Fiji, pipelines sous Jupiter Notebooks avec modèles orientés images biologiques
Jour 1 : Machine Learing
9h-10h Introduction au Machine Learning et Deep Learning (Frédéric)
10h-11h - Machine Learning (classification, clustering) (Thomas)
11h-12h30 / 14h-15h - Session pratique Weka labkit / Ilastik – Fiji (Frédéric)
15h-17h - Deep Learning : apprentissage supervisé, réseaux de neurones, modèles, architectures avancées (réseaux convolutifs et génératifs) (NN, CNN, UNET) (Thomas)
- Session pratique StarDist / Fiji / DeepImageJ / Zoo/ SAMJ
Jour 2 : Deep Learning
9h00 – 11h : Démo Cellpose web / sur stations
11h-12h30 / 14h-15h30 - Présentation et mise en œuvre de DL4MicEverywhere
15h30-17h Utilisation pratique du DL en classification / segmentation : limites, avantages, inconvénients, précautions
Métriques et petit TP avec outil
Equipe pédagogique :
Frédéric BRAU, IRCAN - Inserm U1081 - CNRS UMR7284 – UniCA, Nice, frederic.brau@cnrs.fr
Thomas BOUDIER, Centrale Méditerranée, Morpheme I3S (CNRS/INRIA), thomas.boudier@centrale-med.fr
La formation participe à l'objectif suivant :être directement utile pour la réalisation des travaux personnels de recherche
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