Objectifs :
Vous souhaitez partager vos données (scripts, applications, résultats) de façon sécurisée et reproductible sur n’importe quel type de machine (local, HPC, VM), la conteneurisation avec Apptainer est une solution incontournable.

- Introduction à la notion de conteneur / image / Apptainer
- Installation d’Apptainer
- Création d’une image Apptainer via Docker
- Exécution d’un conteneur Apptainer

Programme :
Première partie théorique qui couvre la présentation de Apptainer ainsi que le principe d’une image et d’un conteneur.

- Définition d’un conteneur
- Son utilité
- Des exemples de différents outils de conteneur (Docker, …)
- Définition d’une image
o Qu’est-ce que c’est
o Le principe
o Les modalités
- Présentation de Apptainer

• Deuxième partie pratique, tutoriel guidé : les participants réalisent chaque étape avec le formateur à l’aide de la démonstration en live de celui-ci.

- Installation de Apptainer sur leur machine
- Construction d’une image Apptainer en utilisant une image Docker ou recette Docker
- Exécution d’un conteneur Apptainer

Pré-requis :
- Ordinateur personnel
- Système d’exploitation Linux, Windows (10/11) avec WSL2
- Notions de base des commandes Linux

Méthode pédagogique :
Cours magistral avec travaux pratiques

Compétences acquises à l'issue de la formation :
- Être capable de décrire les concepts de recette, image, conteneur
- Pouvoir citer les différences entre Apptainer, Singularity, Docker
- Être capable de convertir un fichier de recette en conteneur
- Être capable d’appliquer ces compétences dans un projet / analyse scientifique

Les Compétences et capacités visées à l'issue de la formation (fiches RNCP)

Arrêté du 22 février 2019 définissant les compétences des diplômés du doctorat et inscrivant le doctorat au répertoire national de la certification professionnelle. https://www.legifrance.gouv.fr/loda/id/JORFTEXT000038200990/

Bloc 1 : Conception et élaboration d’une démarche de recherche et développement, d’études et prospective

- Disposer d'une expertise scientifique tant générale que spécifique d'un domaine de recherche et de travail déterminé

- Identifier et résoudre des problèmes complexes et nouveaux impliquant une pluralité de domaines, en mobilisant les connaissances et les savoir-faire les plus avancés

- S’adapter en permanence aux nécessités de recherche et d’innovation au sein d’un secteur professionnel

Bloc 2 : Mise en œuvre d’une démarche de recherche et développement, d’études et prospective

- Mettre en œuvre les méthodes et les outils de la recherche en lien avec l’innovation

Bloc 4 : Veille scientifique et technologique à l’échelle internationale

- Acquérir, synthétiser et analyser les données et informations scientifiques et technologiques d’avant-garde à l’échelle internationale

- Disposer d’une compréhension, d’un recul et d’un regard critique sur l’ensemble des informations de pointe disponibles

La formation participe à l'objectif suivant :être directement utile pour la réalisation des travaux personnels de recherche