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Introduction to experimental planification and data analysis of Omics [Participation : Présentiel]

Contact : LOYAUX Pauline
caroline.remond@univ-reims.fr

Catégorie : Conforter la culture scientifique

Thématique : Formation à la recherche 

Langue de l'intervention : anglais

Nombre d'heures : 15

Crédits/Points : 2

Min participants : 4

Max participants : 12

Nbre d'inscrits : 4

Nombre de places disponibles : 8

Public prioritaire : Aucun

Public concerné :
Doctorant(e)s

Proposé par : Agriculture, Alimentation, Biologie, Environnement et Santé


Lieu : URCA, UFR Sciences Exactes et Naturelles, Moulin de la Housse
Observations : Participants bring their own computer with last version of R
Mots clés : Experimental planification, data analysis, omics
Début de la formation : 29 juin 2026
Fin de la formation : 1er juillet 2026
Date ouverture des inscriptions : 18 mars 2026
Date fermeture des inscriptions : 25 juin 2026
Modalités d'inscription : Inscription by ADUM

Objectifs :
The objectives are to provide participants with a solid foundation in omics data analysis and their underlying principles from experimental plan to interpretation of results. At the end of the training, you will be able to know which method to use to answer data integration questions, to implement these methods with the R software and to interpret the results in numerical and graphical form.

Programme :
1. Introduction to Omics
2. Bioinformatics, Gene Ontology and data analysis
3. Transcriptomics and Proteomics
4. Metabolomics
5. Systems Biology and Integrative Omics


Pré-requis :
User knowledge of R (level 3 of Self-Assessment Questionnaire; participant knows how to run a script and adapt it to their needs)

- Level in R-Self-Assessment Questionnaire (An answer at a certain level assumes that the lower levels (except 0) are also acquired).

0 I don't know what R is
1 I know how to open RStudio but no more
2 I generally understand what an R code does even if I wouldn't have been able to write it on my own
3 I know how to retrieve an existing code and adapt it to my needs
4 I know how to write R code from an empty page
5 I can help my colleagues solve their R problem


Equipe pédagogique :
Claudia Cosio

Méthode pédagogique :
Theory and practical training sessions where participants can learn how to perform omics experiments, analyze omics data using bioinformatics tools, and interpret results

Compétences acquises à l'issue de la formation :
Comprehensive understanding of omics visualization techniques and data analysis


La formation participe à l'objectif suivant :être directement utile pour la réalisation des travaux personnels de recherche

Calendrier :

Séance n° 1
Date :
Horaire : 14h00 à 17h00
Intervenant : Olivier FERNANDEZ
Lieu : Campus Moulin de la Housse- UFR Sciences Exactes et Naturelles- Chemin des Rouliers- BP 1039- 51687 Reims Cedex 2
Intitulé cours : 2H00 CM + 3H00 TD

Séance n° 2
Date :
Horaire : 09H00 à 12H00 et de 14H00 à 17H00à 17h00
Intervenant : Romain PEDEN
Lieu : Campus Moulin de la Housse- UFR Sciences Exactes et Naturelles- Chemin des Rouliers- BP 1039- 51687 Reims Cedex 2
Intitulé cours : 3h00 TD

Séance n° 3
Date :
Horaire : 09H00 à 12H00 et de 14H00 à 17h00
Intervenant : CLAUDIA COSIO- 4H00 CM +3 H TD
Lieu : Campus Moulin de la Housse- UFR Sciences Exactes et Naturelles- Chemin des Rouliers- BP 1039- 51687 Reims Cedex 2
Intitulé cours : 4H00 CM +3 H TD


Inscription au cours




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