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UE07 Statistiques appliquées a la biologie [Participation : Présentiel]

Contact : CIAIS Delphine
med@univ-cotedazur.fr

Catégorie : Ecole Universitaire de Recherche LIFE - Sciences du Vivant et de la Santé (disciplinaire ou académique)

Thématique : Formation à la recherche 

Langue de l'intervention : français

Nombre d'heures : 44

Max participants : 2

Nbre d'inscrits : 3

Nombre de places disponibles : 0

Public prioritaire : Aucun

Public concerné :
Doctorant(e)s

Proposé par : Université Côte d'Azur


Lieu : Campus Valrose
Observations :
Tous les vendredis, de 13h à 17h15, à partir de la première semaine de Septembre, jusqu'à fin Novembre.
Attention : Planning susceptible d'évoluer

Mots clés : Statistiques appliquées, biologie
Début de la formation : 1 septembre 2022
Fin de la formation : 15 décembre 2022
Date fermeture des inscriptions :
Modalités d'inscription : Le nombre maximum de participants est de 2 (+ liste d’attente > Vous pouvez contacter la responsable du master Mme Delphine Ciais)
Site web : https://syllabus.univ-cotedazur.fr/fr/course-info/a0057f5f-cf07-42f7-ab61-d24c5ac64dee/view/light

Objectifs :


  • Interpréter et critiquer des analyses statistiques réalisées avec des tests statistiques classiques

  • Réaliser à l'aide du logiciel R des analyses de type "modèle linéaire", "analyse multivariée" ou "analyse de survie"

  • Interpréter et critiquer des analyses statistiques réalisées dans le cadre du modèle linéaire, d'analyses de survie ou multivariées



Programme :

Cette UE vise à donner aux étudiants une connaissance pratique des techniques statistiques avancées employées dans de nombreux domaines de la biologie. Les grands domaines couverts seront:



  • Rappels de R: manipulation de données et graphiques; tests paramétriques et non paramétriques. Notion de puissance.

  • Modèle linéaire: régression linéaire simple et multiple, colinéarité, ANOVA, ANCOVA, interactions, GLM: régression logistique.

  • Analyse multivariée: composanes principales, analyse des correspondances, analyse discriminante.

  • Analyse de survie.


Si le planning le permet, le bootstrap et les analyses par permutations seront également abordées.


1. Rappels et bases sur les tests statistiques



  • Rappels sur le logiciel R et sur les tests statistiques.

  • Introduction des notions de taille d'effet, taille d'échantillon et puissance.


2. Modèle linéaire



  • Régression linéaire simple et multiple

  • ANOVA(s)

  • ANCOVA

  • Termes d'interactions dans les analyses précédentes


3. Analyses multivariées



  • Analyse en composantes principales

  • Analyses factorielle des correspondances

  • (si le temps le permet) Analyse linéaire discriminante


4. Analyse de survie



  • Théorie, graphiques et analyses classiques de données de survie. Données censurées




Pré-requis :


  • Savoir manipuler des données et produire des graphiques avec le logiciel R

  • Connaître les principaux indicateurs statistiques pour résumer des séries de données: moyenne, médiane, variance, écart-type

  • Connaître les principaux tests statistiques classiques: test de Student, de comparaison de proportion, Chi2




Equipe pédagogique :
Marc Bailly-Bechet

Les Compétences et capacités visées à l'issue de la formation (fiches RNCP)

Arrêté du 22 février 2019 définissant les compétences des diplômés du doctorat et inscrivant le doctorat au répertoire national de la certification professionnelle. https://www.legifrance.gouv.fr/loda/id/JORFTEXT000038200990/

Bloc 1 : Conception et élaboration d’une démarche de recherche et développement, d’études et prospective

- Disposer d'une expertise scientifique tant générale que spécifique d'un domaine de recherche et de travail déterminé


La formation participe à l'objectif suivant :être directement utile pour la réalisation des travaux personnels de recherche


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