• - Connaître les techniques et technologies utilisées en recherche fondamentale et appliquée


• - Maîtriser les modalités de diagnostic du cancer et les possibilités théranostiques


• - Définir les outils de recherche adaptés pour un projet d’étude en oncologie

L'enseignement se fera sous forme de cours magistraux et de travaux dirigés. L’étudiant, au cœur de son propre processus d'apprentissage, sera amené à participer lors de ces enseignements, qui se veulent interactifs et constructifs.

Jour 1 : Biopsies liquides

Matin

• * Hématopoïèse normale et pathologique, cellules souches


• * Cellules circulantes et ADNc

Après-midi

• * Exosomes et autres nanovésicules


• * Facteurs pronostiques biologiques, marqueurs tumoraux et suivi de maladie résiduelle

Jour 2: Biopsies solides

Matin

• * Prise en charge diagnostique, pronostique et théranostique des cancers


• * La cytogénétique ; quand, comment ?

Après-midi

• * Outils d’aide à l’analyse des biopsies, machine learning

Jour 3: Cellules souches et OMIque

Matin

• * Des cellules souches au cœur des tumeurs


• * Les IPS véritable plateforme technologique en recherche médicale sur le cancer

Après-midi

• * Genomic OMICS : Innovations technologiques à l’échelle de la cellule unique pour disséquer les circuits moléculaires du cancer, du primaire aux métastases (NGS, RNA-seq, ATAQ-seq et CITE-seq)


• * Proteomique, Metabolomique

Jour 4 : Imagerie histologique et modèles animaux

Matin

• * H&E, immunohistochimie multiplex


• * Techniques: Immunofluorescence, short term-culture, Patients derived xenograft, Imagerie intravitale

Après-midi

• * La biopsie au laboratoire de recherche: pour quoi faire ? Modèles : ex-vivo, organoïdes


• * Modèles GEM (ex. zebrafish)

Jour 5: Canaux ioniques, imagerie fonctionnelle et médicale

Matin

• * Evaluation en cancérologie (RECIST, RECISTm, PERCIST…)


• * Les nouvelles techniques d’imagerie et Apports de l’IA en Imagerie Médicale

Après-midi

• * Introduction générale aux canaux ioniques


• * Canaux ioniques et transporteurs SIN


• * Imagerie fonctionnelle et théranostique

• - Avoir validé le Master 1 scientifique, médecine, pharmacie, école vétérinaire ou écoles d'ingénieur


• - Avoir un niveau suffisant (B1) en Anglais (compréhension écrite, notamment pour la lecture d'articles scientifiques)


• - Maîtriser les grandes fonctions physiologiques de la biologie cellulaire

• - N. Arrighi (C3M)
• - D. Ambrosetti (CHU)
• - N. Amoretti (CHU)
• - G. Baudin (CAL)
• - F. Bost (C3M)
• - F. Burel-Vandenbos (CHU)
• - T. Cluzeau (CHU)
• - L.Counillon (LP2M)
• - B. Dadone-Montaudié (CHU)
• - X. Descombes (INRIA)
• - G. Cristofari (IRCAN)
• - P. Colosetti (Lyon)
• - J.M. Ferrero (CAL)
• - M. Godinho-Ferreira (IRCAN)
• - M. Ilié (CHU)
• - M. Irondelle (C3M)
• - S. Lassalle (CHU)
• - T. Pourcher (CEA)
• - E. Saada (CAL)
• - T. Virolle (iBv)
• - L. Yvan-Charvet (C3M)
• - C. Zwarthoed (CAL)

Diagnostiquer le cancer : Techniques et technologies au service du chercheur et du clinicien

Chaque type de cancer porte une signature cellulaire et moléculaire distincte. Grâce aux avancées technologiques, les médecins et les chercheurs ont aujourd’hui recours à différents types d’analyses cellulaires, moléculaires et d’imagerie pour détecter le cancer et identifier les différences entre les cellules cancéreuses et les cellules saines. Les enseignements ont pour objectif de présenter ces différentes technologies et leurs applications en clinique et en recherche.

Les thématiques abordées seront les suivantes :

• - Biopsies liquides 


• - Biopsies solides


• - Cellules souches et OMIque 


• - Imagerie histologique et modèles animaux 


• - Canaux ioniques et imagerie médicale 

Les enseignements offrent, pour chaque thématique, une description des aspects fondamentaux puis leurs implications en recherche clinique et en thérapeutique.

Les Compétences et capacités visées à l'issue de la formation (fiches RNCP)

Arrêté du 22 février 2019 définissant les compétences des diplômés du doctorat et inscrivant le doctorat au répertoire national de la certification professionnelle. https://www.legifrance.gouv.fr/loda/id/JORFTEXT000038200990/

Bloc 1 : Conception et élaboration d’une démarche de recherche et développement, d’études et prospective

- Disposer d'une expertise scientifique tant générale que spécifique d'un domaine de recherche et de travail déterminé